药品是疾病的物质；保健(功能)食品的本质仍然是食品，虽有调节人体某种机能的作用，但它不是人类赖以疾病的物质。对于生理机能正常，想要维护健康或预防某种疾病的人来说，保健(功能)食品是一种营养补充剂。对于生理机能异常的人来说，保健(功能)食品可以调节某种生理机能、强化免疫系统。从科学角度讲，注意平时营养均衡的饮食、有规律的生活习惯、适时适量的运动、保持开朗的性格，才是健康的根本保证。
食品中还有一类特殊营养食品，是"通过改变食品的天然营养素的成分和含量比例，以适应某些特殊人群营养需要的食品(《特殊营养食品标签》3.l条)。如适应婴幼儿生理特点和营养需要的婴幼儿食品、经添加营养强化剂的食品，都属于这类食品。特殊营养食品与保健(功能)食品的共性是：都添加或含有一定量的生理活性物质，适于特定人群食用。区别是：前者不需要通过动物或人群实验，不需要证实有明显的功效作用；而后者必须通过动物或人群实验，证实有明显、稳定的功效作用。
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